MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus LGA251 plasmid pLGA251

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017348	ATATT	2	10	42	51	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017348	ATTT	2	8	54	61	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017348	AACAA	2	10	66	75	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_017348	ATA	2	6	671	676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017348	TTC	2	6	797	802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017348	TAAA	2	8	863	870	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017348	ATTA	2	8	873	880	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017348	ATT	2	6	896	901	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017348	TTCA	2	8	912	919	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_017348	TAA	2	6	975	980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017348	T	6	6	1020	1025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017348	TAA	2	6	1095	1100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017348	GAAC	2	8	1138	1145	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_017348	AT	3	6	1153	1158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_017348	ATC	2	6	1173	1178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_017348	AAAT	2	8	1210	1217	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017348	AT	3	6	1216	1221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017348	AT	3	6	1528	1533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_017348	TACA	2	8	1559	1566	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_017348	T	6	6	1594	1599	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_017348	A	6	6	1602	1607	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_017348	A	6	6	1613	1618	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017348	TCA	2	6	1627	1632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017348	TAT	2	6	2583	2588	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_017348	TAG	2	6	2610	2615	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017348	TAT	2	6	2616	2621	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017348	TAT	2	6	2645	2650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017348	TAA	2	6	2667	2672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_017348	T	6	6	2684	2689	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017348	AT	5	10	2753	2762	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017348	TA	3	6	2779	2784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_017348	CAAGA	2	10	2789	2798	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017348	A	8	8	2822	2829	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_017348	CTT	3	9	2840	2848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_017348	TAAA	2	8	2867	2874	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017348	AATA	2	8	2893	2900	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_017348	ATA	2	6	2971	2976	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_017348	AAT	2	6	2978	2983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.